島津評論 Vol.70[3・4](2013)
特集 ライフサイエンス

特集論文

リボソームタンパク質をバイオマーカーとしたMALDI-TOF MSによる細菌識別
─ S10-GERMS法による細菌の迅速識別 ─

田村　廣人1堀田　雄大1,2島　圭介3船津　慎治4

島津評論 70〔3・4〕 157～170 (2014.3)

要旨

これまでのリボソームタンパク質をバイオマーカーとした微生物同定法は，系統解析をする上で次のような課題が存在した；1）基準株（Type strain）のゲノム解読情報が必要である；2）ゲノム解読されたリボソームタンパク質データベースにエラーが存在する；3）種レベルの系統学的距離を示すことが困難である。そこで，細菌に共通に存在するS10-spc-alphaオペロンにコードされるリボソームタンパク質をバイオマーカーとした MALDI-TOF MS（Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry）による細菌同定・識別法（S10-spc-alpha operon Gene Encoded Ribosomal protein Mass Spectrum : S10-GERMS法）を確立した。本S10-GERMS法に使用するS10-spc-alphaオペロンは，約半数のリボソームタンパク質と数種のハウスキーピング遺伝子をコードするため，本オペロンの配列決定と MALDI-TOF MS測定により，データベース構築，校正および最適なリボソームタンパク質の選択が可能になり，種および株レベルの迅速・簡便な系統解析が可能であることを初めて示した。

1名城大学 農学部 農学博士
2クミアイ化学工業株式会社 生物科学研究所 農学博士
3分析計測事業部 グローバルアプリケーション開発センター
4分析計測事業部 ライフサイエンス事業統括部 MS ビジネスユニット

論文請求

※島津評論に掲載されている情報は、論文発表当時のものです。記載されている製品は、既に取り扱っていない場合もございますので、ご了承ください。