2014.8.6 “Mass++”を紹介する論文が発刊されました-次世代質量分析システム開発と創薬・診断への貢献：最先端研究開発支援プログラム（FIRSTプログラム）

　Mass++は、種々の質量分析装置から得られたデータを表示・解析することが可能なフリーのソフトウェアです。

　これまで本サイトでは、様々なフリーウェアの紹介・アップロードを行い、学会等でも数多くの発表を行ってきましたが、Mass++そのものを学術論文としてまとめて発表するのは初めて、しかもプロテオーム関連として世界的に著名な”Journal of Proteome Research”に紹介論文が掲載されました。

　本論文では、Mass++の要点のみですが、機能・利点を網羅的に紹介しています。Abstractにも記述されているMass++の特徴を、改めて箇条書きにします。

– mzXML, mzML, netCDF の様な共通フォーマットの他、LCMSsolution, GCMSsolution (Shimadzu), Launchpad (Kratos), Xcalibur (Thermo Scientific), Analyst, AnalystQS (AB Sciex), MassLynx (Waters), MassHunter (Agilent) 等々、様々なベンダーが提供する生データフォーマットにも対応しています。
– スペクトル・クロマトグラム波形、ヒートマップ3D 表示等、様々な表示機能を持っています。
– LC/MS データだけでなく、糖鎖解析でもよく使われるMALDI データにも対応した解析機能を持っています。
– Mascot や X! Tandem の様なProteome同定エンジンの他、MassBankとの連携機能も持ち、ProteomicsとMetabolomicsの解析を統合的に行う事ができます。
– Softwareが”Plug-In”形式になっており、機能を追加したり削除したりする等のカスタマイズが行なえる他、開発者が新たな機能を追加する際には、Mass++ のSource Codeを編集する事無しに新たなPlug-Inを開発する事で独自アルゴリズムの作成や自動化処理を作成する事ができます。

Satoshi Tanaka¹, Yuichiro Fujita¹, Howell E. Parry¹, Akiyasu C. Yoshizawa¹, Kentaro Morimoto¹, Masaki Murase¹, Yoshihiro Yamada¹, Jingwen Yao¹, Shinichi Utsunomiya¹, Shigeki Kajihara¹, Mitsuru Fukuda^2,3, Masayuki Ikawa^2,3, Tsuyoshi Tabata², Kentaro Takahashi², Ken Aoshima², Yoshito Nihei⁴, Takaaki Nishioka⁴, Yoshiya Oda², Koichi Tanaka¹
“Mass++: A visualization and analysis tool for mass spectrometry”
Journal of Proteome Research, Vol. 13, Issue 8, pp3846-3853

1 Koichi Tanaka Laboratory of Advanced Science and Technology, Shimadzu Corporation
2 Eisai Product Creation Systems, Eisai Co., Ltd.
3 iBioTech Corporation
4 Graduate School of Information Science, Nara Institute of Science and Technology

発表資料（Journal of Proteome Research掲載論文概略紹介へのリンク）

Mass++特徴紹介サイト：
/aboutus/ms_r/soft.html