近年，MALDI-TOFMS 装置の普及に伴い，その機能を活用した様々な分析手法が開発され，試料の分子量を迅速・高感度・高精度で測定するのみならず，構造情報までも入手する方法が数多く考案され，活用されてきている。

構造情報を最も幅広く入手できる手法は，MS 測定も可能な MS/MS 装置を用いることになるが，比較的コストの安いMS 測定のみの装置でも導入可能な手法も多数存在する。例えば，試料の分解を促進するマトリックスの採用，酵素消化等の化学反応との組み合わせがある。また，コンピュータの処理・解析能力を活用した手法も開発されている。

本稿では，これらの手法とその特徴を紹介する。